在云南明清双方你争我夺的时候，四川夔州明军早在数月前，就对奉节进行了攻击，并且顺利收复奉节，巫山两城，彻底掐断了清军通过水路入川的通道。
时间回到永历十四年六月，就在秦江返回腾越后，李来亨等人围攻奉节的战争迅速展开。
三块石。
自巫山而来的清军援兵被郝摇旗带领的明军推动从山顶滚下的巨石截成三段，首尾不能相顾，上有箭矢滚木如雨，下面官道狭窄无比，无处可避，数千清军如同无头的苍蝇，死伤惨重。
郝摇旗等滚木擂石全部用罄后手执大刀，一马当先冲下山谷，带着明军士兵如同虎入羊群，势不可挡，山谷中幸存的清军几乎个个带伤，毫无还手之力。以前他们与夔州明军也作战无数次，一直都占据上风，这回轻敌冒进之下，被明军来了记狠的。
半个时辰后，三块石阻击战结束，清军除后军数百人仓皇逃去外，其余几乎全军覆没。
为防止清军再度来援，郝摇旗留下了一千士兵在此地驻防，其余明军全部返回奉节，准备协助明军主力攻击奉节城。
奉节城内，那些投靠清廷的地主武装有一部分在明军刚开始围城的时候就已经弃城而逃，只留下三千吴三桂嫡系军队和一千杂牌军队在总兵吴宁的率领下与倾巢而出的近六万明军对峙。
“总兵大人，这城恐怕守不住了，要不我们还是趁现在江面未被封锁，赶紧出城，要不然恐怕得死在这奉节城里头！”把总张庆被不断逃跑的士兵和城外数量众多的明军吓得魂不附体，一个劲苦劝吴宁放弃奉节逃命。
吴宁也陷入了纠结，但是如果不战而逃，就算吴三桂放过他，朝廷也不会放过他，吴宁深知朝廷对待绿营罪臣的苛刻，他如果敢弃城，那绝对是要被问斩的。
“先抵抗，实在不行就逃跑，逃不了便投降！”吴宁拿定了主意，明军不斩降将，至少能逃得一条性命。
张庆无奈离去，如果主将不逃，自己跑了的话，没人顶锅，上面责罚下来，他的脑袋肯定保不住。
“算了，还是先做好准备，弄一条船藏在江边，等城破时趁乱逃走，到时就算朝廷责罚，也不至于掉了脑袋。”张庆的脑瓜子比吴宁的转得快，他可不敢把性命交到明军手上，这些夔州明军和他们一直作战，双方仇深似海。
清军在吴宁的命令下开始全力进行守城准备，在公开处决了一些逃兵后，再也无人敢逃，四千守军战战兢兢地等待着明军的进攻。
六月十五，晴空万里，在号角声中，明军开始了对奉节城的进攻。
这次出击，夔州明军精英尽出，压箱底的攻城弩都全部抬了出来，要趁着四川清军实力大减这个难得的良机摆脱被困在夔东的窘境，在云南明军的配合下荡平四川境内的清军，云川两地重归大明。
漫天的箭雨覆盖了狭窄的奉节城头，吴宁这才发现自己想要用数千人对抗数万人的想法是多么可笑，四轮箭雨过后，奉节守军已经死伤大半。
明军在箭雨停止后便举着云梯，蜂拥而上，奉节城就像洪水中的小舟，好像顷刻间就会被淹没。
轰隆隆，在吴宁的全力弹压下，清军开始反击，一根根巨大的滚木从陡峭的奉节城头滚滚而下，带着雷霆万钧之势砸向攻城的明军。
“快躲！”明军中的军官大声提醒士兵躲避，但滚木来势极快，还是有躲避不不及的明军士兵被滚木砸中，顿时被巨大的滚木裹挟着一路狂冲至湍急的江水里，鲜血把碧绿的江水染得血红。
“继续冲！”明军在互相鼓励着继续冲向城墙，守军滚木很快就全部放完，没有了滚木威胁的明军很快攻上了奉节城头，一场屠戮很快展开。
明军源源不断的攻上城头，杀光守军后打开了城门，更多的明军士兵继续涌入城内，向退往城内的守军围杀而去。
吴宁肩上中了一箭，被自己的亲卫拖着退到了夔州府衙，清军溃兵也都纷纷聚拢在府衙周围，准备最后殊死一搏。
张庆换上早就准备好的普通百姓衣服，躲在民房内不敢出去，心里盘算着如何逃离奉节城。明军破城太快，让他有些猝不及防。听着屋外传来的喊杀声，他的双腿都在打颤。
府衙周围，两万入城明军把夔州府衙围得密不透风，本来还准备做出最后抵抗的守军失去了最后一丝勇气，纷纷放下兵器，跪地祈降。
“你们的主将吴宁呢，死了吗？”明军攻城主将荆国公王光兴对降兵大声喝道。
降兵们的目光不约而同的看向了一名身着普通士兵衣甲的中年士兵，吴宁无奈苦笑，站了起来道：“我就是吴宁，既然战败，要杀要剐，任由你们处置便是！”
“全部押下去！”这些降卒可是以后开荒种地的主力军，不能让他们跑了，王光兴想起太子信中对四川的安排，眼神发亮。
“奉节和白帝城拿下，我们要尽快联系太子殿下，建立稳固城防，以应对清军反攻！”李来亨在收复奉节后，立即决定派人前往腾越传去捷报，让朱慈煊对下一步的行动下达旨令。
过了几日，逃到巫山的张庆将奉节失陷的消息上报到了坐镇长沙的洪承畴那里。
洪承畴上奏朝廷后，无奈地对巫山的清军下达了撤入湖北的命令，夔州府彻底脱离了清军掌控，一直被困在夔东山区的明军开始想有着天府之国美誉的成都挺进，重庆成了一座孤城。
洪承畴没有放弃重庆，实在是重庆过于重要，而且还有云南和贵州的清军支援，暂时还比较安全。
而明军也没有立即攻击重庆的打算，重庆守军人数众多，城墙也较为高大，城内地势复杂，就算能攻下，那伤亡肯定也比较大。
朱慈煊在信中交代李来亨等人，重庆城要等到云南府决战完成后，云南明军会通过水路运送火炮至重庆，那时才是进攻重庆的最好时机。