皇子凯旋而归后，整个皇宫沉浸在胜利的喜悦之中。皇上举办了盛大的庆功宴，犒赏三军将士，朝堂上下一片欢腾。然而，萧思蓉与南妘莲却并未被这表面的繁华冲昏头脑，她们深知，这场战争虽然胜利，但也暴露了许多问题。
在战争中，朝廷的兵力虽强，但军备物资的调配却显得有些力不从心，许多士兵的武器装备陈旧，粮草运输也时有延误。南妘莲意识到，若要真正保障国家的长治久安，必须对军事后勤体系进行大刀阔斧的改革。于是，她在朝堂上提出了一系列改革方案，包括建立专门的军备研发机构，加强与各地粮仓的统筹管理，以及开辟新的粮草运输路线等。然而，这些改革方案触动了许多既得利益者的奶酪，他们在朝堂上暗中勾结，对南妘莲的提议提出了诸多质疑与反对。
萧思蓉则在后宫之中，发现了一些微妙的变化。一些妃嫔开始对她和皇子阿谀奉承，试图拉近关系；而另一些则在背后散布谣言，说皇子在战场上的功劳是虚报的，意图离间他们母子与皇上的关系。萧思蓉深知后宫争斗的险恶，她不动声色地加强了对皇子的保护，同时也开始调查这些谣言的源头。
一日，萧思蓉收到密报，称在京城外的一处秘密庄园中，有一些神秘人物频繁出入，这些人似乎与朝中反对南妘莲改革的势力有所勾结，并且还与边疆的邪恶组织有联系。萧思蓉决定与南妘莲一同前往探查。
当她们悄悄潜入庄园时，发现里面竟藏有大量的兵器和谋反的文书。原来，朝中的一些奸臣与边疆的邪恶组织勾结，企图在国内制造混乱，推翻皇上的统治，然后瓜分天下。而他们所选定的傀儡，竟是一位一直隐藏在暗处的王爷。这位王爷表面上对皇位毫无野心，实则一直在暗中积蓄力量，等待时机。
萧思蓉与南妘莲深知此事非同小可，她们带着证据匆匆回宫，向皇上禀报。皇上听闻后，大为震怒，立即下令逮捕涉案的大臣和王爷。然而，王爷似乎早有准备，他在京城中秘密安插了许多眼线，提前得知了消息，率领手下的叛军在城中发动了叛乱。
皇宫瞬间陷入一片混乱之中，叛军如潮水般涌来，守卫皇宫的士兵们虽奋力抵抗，但却因寡不敌众，渐渐陷入绝境。萧思蓉与南妘莲临危不乱，她们组织起宫中的侍卫和宫女太监，与叛军展开了殊死搏斗。皇子也挺身而出，带领着自己的亲信，在皇宫中筑起了一道防线。
在战斗最激烈的时候，南妘莲突然想起，皇宫之下有一条通往城外的密道，这条密道是当年先皇为了以防万一而修建的。她急忙带着萧思蓉、皇子和皇上等人，通过密道逃出了皇宫。
出了皇宫后，他们发现城外的局势也不容乐观。许多地方都被叛军占领，百姓们四处逃亡。萧思蓉建议皇上前往南方，那里有许多忠臣良将，且地势险要，易守难攻。皇上采纳了她的建议，一行人乔装打扮，向着南方进发。
在南方，他们得到了当地官员和将领的支持，迅速组织起了一支军队，准备反攻京城。然而，叛军也深知南方的威胁，他们派出了大军，企图在南方将皇上等人剿灭。
两军在一片平原上展开了一场惊心动魄的大战。战场上，硝烟弥漫，喊杀声震天。皇子身先士卒，率领着将士们奋勇杀敌，他的身影在战场上如同一面旗帜，激励着将士们的斗志。萧思蓉与南妘莲则在后方指挥调度，她们根据战场的形势，灵活地调配着兵力和物资。
经过一场惨烈的战斗，皇上的军队终于取得了胜利，叛军被彻底击溃。他们乘胜追击，一路收复失地，最终回到了京城。
经此一役，朝廷的格局发生了巨大的变化。许多奸臣被清除，朝政焕然一新。皇子在这场战争中的表现，让他赢得了天下百姓的爱戴和拥护，他顺利地登上了皇位，成为了一代明君。
萧思蓉被尊为太后，她在后宫中继续发挥着自己的智慧，辅佐着新皇治理国家。南妘莲则被封为护国公主，她在朝堂上与新皇共同商议国家大事，推行了一系列利国利民的政策，国家逐渐走向繁荣昌盛，开创了一个太平盛世。而她们在宫闱风云中的传奇故事，也被人们传颂千古，成为了历史长河中一颗璀璨的明珠。